В большинстве тем дизайна эта возможность предусмотрена по умолчанию. Если вы не видите ее в вашей теме дизайна, посмотрите шаблон product.cart.html — найдите блок, отвечающий за ввод количества input type="text" name="quantity" и раскомментируйте его.
